Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms