Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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