Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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