Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms