Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms