Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms