Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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