Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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