Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sgms1Q8VCQ6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sgms1Q8VCQ6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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