Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ubxn4Q8VCH8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ubxn4Q8VCH8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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