Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Top1mtQ8R4U6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms