Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms