Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcsapQ8QZT2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms