Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hecw1Q8K4P8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hecw1Q8K4P8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hecw1Q8K4P8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hecw1Q8K4P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hecw1Q8K4P8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms