Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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