Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms