Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms