Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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