Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms