Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl11Q8CE33 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl11Q8CE33 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl11Q8CE33 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl11Q8CE33 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl11Q8CE33 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl11Q8CE33 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl11Q8CE33 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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