Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
9030612E09RikQ8CE20 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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9030612E09RikQ8CE20 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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9030612E09RikQ8CE20 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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9030612E09RikQ8CE20 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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9030612E09RikQ8CE20 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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9030612E09RikQ8CE20 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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9030612E09RikQ8CE20 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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