Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms