Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms