Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms