Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms