Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms