Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop53Q8BK35 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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