Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms