Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Liat1Q810M6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Liat1Q810M6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms