Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc1Q80VQ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc1Q80VQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms