Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2eQ80UW8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms