Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube3cQ80U95 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube3cQ80U95 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms