Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccp110Q7TSH4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms