Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms