Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sys1Q78S06 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms