Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms