Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms