Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynmQ70IV5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynmQ70IV5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms