Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms