Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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