Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpm4Q6IRU2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms