Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms