Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms