Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms