Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms