Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms