Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Col4a5Q63ZW6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Col4a5Q63ZW6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Col4a5Q63ZW6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Col4a5Q63ZW6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms