Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms