Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik1Q60934 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik1Q60934 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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