Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rasa3Q60790 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms